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新冠病毒最早于2019年10月份在所有国家几乎同时传播?

时间:2011-10-03

文章内容来自伦敦大学学院遗传学研究所领衔于5月5日预发表在感染,遗传和进化杂志上一篇题为Emergence of genomic diversity and recurrent mutations in SARSCoV2的研究报告

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新冠病毒最早于2019年10月份在所有国家几乎同时传播?

近日,一篇题为【英国研究:新冠最早始于去年十月,“所有国家几乎同时传播”】广泛传播。

文章内容来自伦敦大学学院遗传学研究所领衔于5月5日预发表在“感染,遗传和进化”杂志上一篇题为“

Emergence of genomic diversity and recurrent mutations in SARS-CoV-2”的研究报告。

而国内最早报道这一内容的是央视,是对美国CNN一篇报道的摘要。

从【英国研究:新冠最早始于去年十月,“所有国家几乎同时传播”】这篇网传热文的标题,人们很容易被误导,认为:“新冠病毒最早于去年10月份开始在所有国家几乎同时传播”。

新冠病毒在“所有国家几乎同时传播”?

或许会有人会反问:难道不是吗?

真不是。

因为,“新冠最早始于去年十月”,和“所有国家几乎同时传播”是不同的两个部分。

后者是基于在不同时间从全球不同地区所采集到的新冠病毒样本测得的基因序列作为为实证总结出来的。

图中,不同颜色代表病毒样本采集的地区,绿色:亚洲; 红色:欧洲; 紫色:北美; 橙色:大洋洲; 深蓝色

:南美。

图中坐标位置则代表采集的时间,越靠内圈时间越早,越靠近外圈时间越晚。

由于第一份病毒基因序列(NC_045512.2,EPI_ISL_402125)是1月5日采集在武汉一位病人的武汉-Hu-1,也就是我国与世界分享的全球首份新冠病毒全基因序列,所有基因分析都是以此序列作为参照进行的。

而研究截止采集时间是4月19日,时间越靠后采集到的病毒样本数量越多。

迄今,各地上传的基因序列已经超过了16000份,研究所采集的是截止4月19日标记为“完整”的序列的7710份序列中最终使用7666份建立了分析数据集。

也就是说,“所有国家几乎同时传播”(不管这个说法是否准确)的结论是基于实证得出的,是2020年1月5日及以后的事情。

“新冠最早始于去年十月”?

前者,“新冠最早始于去年十月”则是基于遗传分析数学模型推测出来的虚拟结论。

这个结论是怎样得出的呢?

作者通过对7666份病毒样本采集的时间和地点,以及这些病毒基因序列的遗传信息建立了进化树。

通过分析不同病毒基因的变异性可以推测出不同病毒簇“最近的共同祖先”(Most Recent Common Ancestor),以及其出现的时间(tMRCA)。

通过对所有收集到的病毒基因组的分析就可推测出新冠最早的共同祖先,以及出现的时间。

研究推测出的7666份病毒基因的最早共同祖先可能出现的时间在2019年10月6日到2019年12月11日之间。

这就如同,如果知道一个大家族族谱中记载的1到20代部分家庭和成员的出生日期和出生地,就可以通过基因分析推测出他们族谱记录之前不同世祖,以及最早的原始世祖可能的出生时间和出生地。

回到研究中“新冠病毒最早共同祖先可能出现的时间在2019年10月6日到2019年12月11日之间”这个推定,由于第一个病毒基因是1月5日采集,最后的采集时间截止4月19日,期间整整3个半月。

而从2020年1月5日到2019年10月6日到2019年12月11日的时间分别是3个月到1个月。

这也就相当于说,从一个族群3500年有记载的历史,向上推测出该族群的最早共同祖先出现在史前1000年到3000年之间。

也就是说,“新冠最早始于去年十月”,是根据基因分析得出的线索而推测出的虚拟的可能结论,而且是统计学上可信区间最早的时间。

因此,【英国研究:新冠最早始于去年十月,“所有国家几乎同时传播”】这个标题具有很大的误导性,属于标题党范畴。

而且,“新冠最早始于去年十月”的说法也并不新鲜。

此前面一些基于小的基因组数据得出的结论与此相符,推测出最早共同祖先出现的时间大致在2019年10月到2020年1月份之间。

其中一项,由于分析样本少,得出的数据误差较大,可信区间内最早时间甚至推到了2019年5月2日。

因此,英国研究中“新冠最早始于2019年10月6日”仅仅是基于数据得出的统计学上可信区间内最早可能的时间。

这样,如果把研究结论说成或理解成“新冠病毒最早于2019年10月份开始在所有国家几乎同时传播”,则大错特错。

新冠病毒唯一共同祖先出现在亚洲?

这项研究得出的被很多人认为“不利于”我们的结论是,2019年10月6日到2019年12月11日间最早共同祖先出现在亚洲。

这并不奇怪。

因此,研究是基于上传到全球共享数据库已有的基因序列,第一份是1月5日我国上传,而最早上传基因序列的病毒也主要采集自亚洲。

但是,这个结论并不能证明新冠病毒就起源自亚洲。

新冠病毒全球大流行的传播中心是意大利

这项研究通过世界各地流行病毒的基因多样性分析得出的一个重要结论是:

新冠病毒全球大流行的传播中心是意大利。

由于新冠病毒隐形传播的流行病学特点,疫情大暴发之前已经存在广泛的传播。

不可否认,在我国“封城”封城之前已经有少部分病毒传出。

但是,大量研究都显示,我国即使的“封城”已经将这种传播限制在最低范围内。

最能说明这一点的是,由于当时正值春节假期人流高峰,武汉和湖北流向我国各地,特别是周边地区的人员数量巨大,的确造成了一定传播。

但是,由于我们采取了即使而严格的社会隔离措施,最大限度地切断了传播途径,仅仅用了不到2个月就控制了疫情。

而全球大流行发生在3月份,在意大利大暴发之后,显而易见,全球大流行是欧洲特别是意大利大暴发向全球输出病例引发的。

这项迄今最大规模的遗传分析也再次证明了这一点。

而且,其他一些病毒基因分析也同样证明,包括美国纽约,英国,南美等等不同地区的流行的主要病毒毒株都来自于出现在意大利病毒。

比如,5月6日,美国洛斯阿拉莫斯国家实验室等多家机构发表的研究就显示,世界上大多数地区传播的病毒都是2月初出现在欧洲的带有G614突变的毒株。

意大利的大暴发才是造成全球大流行直接的传播中心。

这充分说明,一方面,我国严格的防疫措施极大控制了病毒的传播,为世界各国赢得了充分的准备时间;

最重要的是,世界各国没有正视和重视我国和WHO发出的警告,既没有采取积极的准备,而且有限的防疫措施还错了方向:。

新冠疾病,作为一种人畜共患疾病,病毒从动物跳到人类造成感染和流行这是不可避免的随机事件。

历史上给人类造成极大健康危害和灾难的流行病三分之二是来源于动物的人畜共患疾病,全球各地都可以是疫情最早的出现地。

比如,虽然迄今给人类造成最大灾难的1918年大流感被错误命名为“西班牙大流感”,而据研究真正的起源地在美国。

因此,病毒最早出现在哪里不是关键,正确及时的防疫措施才是疫情发展趋势及造成多大危害的决定因素。

这一次新冠疫情之所以发展成现在的灾难性大流行局面,最根本原因在于世界各国采取了错误的,早期甚至“隔岸观火”的防疫态度和策略。

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